海關在推動加工貿易產業升級、延長加工貿易產業鏈、提升加工貿易附加值方面積極探索，取得了顯著成效。
目前世界500強已有480家落戶我國，加工貿易已使我國發展成為規模巨大的“世界加工廠”。其構成主要包括：12.6萬家加工貿易企業、99個海關特殊監管區域、25個保稅物流中心、720個保稅倉庫、118個出口監管倉庫。這個“世界加工廠”，解決了4000萬人員直接就業，占我國第二產業就業人數的20%。
今年以來，面對后金融危機時期出現的新情況、新變化，海關總署及時調整有關政策，積極貫徹落實國家節能減排各項措施，會同商務部進行了加工貿易禁止類目錄調整工作，將硅材料等44種商品增列入加工貿易禁止類目錄，嚴格限制“兩高一資”產品的加工貿易出口，促進加工貿易轉型升級。同時，海關總署出臺措施全面推廣服務外包保稅監管模式，在試點基礎上，從7月1日起，將服務外包保稅監管從原有的10個試點城市推廣至目前全部21個服務外包示范城市，并制定出臺了相關管理辦法，進一步加大對服務貿易的支持力度。此外，海關總署會同相關部門開展了加工貿易轉型升級試點城市和梯度轉移重點承接地認定，將蘇州、東莞列為加工貿易轉型升級示范城市，將遼寧錦州市等13個城市列入第三批加工貿易梯度轉移重點承接地，從產業和區域角度積極引導加工貿易轉型升級。
位于江蘇蘇州昆山綜合保稅區內的無敵數碼科技（昆山）有限公司決定將自有品牌的銷售部分進行剝離，成立貿易有限公司。這是公司針對昆山出口加工區轉型為綜合保稅區后功能更集中采取的戰略性轉型新舉措。無敵數碼科技（昆山）貿易有限公司總經理沈復君告訴記者：“海關政策和服務都升級了，我們也要順勢而為。”
對于已落戶海關特殊監管區10年的仁寶集團，已經成長為年產值千億元企業，躍居全球筆記本電腦代工業第一把交椅。集團總經理陳瑞聰介紹說：“公司的快速發展，有賴于海關特殊監管區域政策功能的優勢和海關提供的優質高效的服務。”隨著昆山綜合保稅區的正式通過驗收，仁寶集團不僅于今年4月在綜保區成立了研發中心，還將設立區域總部和4個生產工廠，實現從“生產車間”到“企業總部”轉變。
昆山綜合保稅區將由原先的單純加工制造轉向重點發展貨物貿易、服務貿易，通過內外銷并舉，向研發、銷售等價值鏈高端攀升。昆山綜合保稅區已發展成為百強縣之首昆山的“轉型升級示范區”和“新興產業引領區”，承載著昆山人三年“再造一個昆山”的目標和期待。目前包括緯創資通的循環經濟綠資源基地，寶成集團銷售總部、昆達集團所轄聯達導航全球營運中心、票據處理中心，西門子下屬歐斯朗公司特種光源銷售總部等項目都紛至沓來。
“我們創科公司一年投入市場的新產品超過300款，而且價格制訂全部由我們主導。”東莞創科實業有限公司總監何柏林自豪地說。“議價權”成了公司高層經常提起的一個“關鍵詞”。
東莞創科實業有限公司前身是東莞厚街科技電業公司，是一家來料加工企業，由于來料加工企業沒有獨立的法人資格，公司只能按訂單進行加工生產，價格也只能由國外買家來定，利潤空間低。
在黃埔海關的幫助下，企業順利地由來料加工企業轉型為三資企業，具備了獨立的法人資格。轉型后的創科公司不再像以前那樣只從事簡單的貼牌生產，還可以根據市場的需求情況來自主設計。在轉變的過程中，公司也逐漸掌握了市場的議價權。
像創科實業公司這樣轉型后獲得新發展的企業在東莞為數不少，東莞加工貿易轉型升級取得了明顯的成效。東莞號稱中國“加工貿易之都”，有加工貿易生產型企業近12000家。海關加強與東莞市政府等部門的聯系溝通，大力支持東莞建設全國加工貿易轉型升級示范區，與東莞市政府共同制定了促進加工貿易轉型升級和內銷便利化方案，通過簡化企業轉型和搬遷手續、擴大深加工結轉管理系統試點、加快外發加工業務制度改革等措施，鼓勵和支持加工貿易企業充分利用國際國內兩個市場，助力企業實現經營性質和銷售市場的雙轉型，幫助企業創立自主品牌，增強企業研發能力，提升東莞加工貿易的核心競爭力。截至目前，全市共有1600多家來料加工企業轉為三資企業，其中2009年，共988家加工貿易企業新創立了自主品牌。轉型后的企業從原來單純的貼牌加工逐漸轉向研發、設計、核心制造。有關資料顯示，近兩年來，東莞加工貿易企業新增研發機構304個，新增加工貿易高新技術企業184家，全市出口300強企業基本上實現了“設計+生產”的運作模式，odm生產制造產品出口占全市加工貿易出口超過60%。
通過創新，江蘇蘇州、廣東東莞等位于東部沿海的加工貿易企業正從產業鏈的低端向高端進軍。而在中西部，加工貿易發展也正如火如荼。根據國家區域發展總體戰略和主體功能區戰略，海關報國務院批準，對部分已有的海關特殊監管區域進行了整合，在中西部地區優先考慮并設立了一批出口加工區、綜合保稅區、保稅港區，引導產業有序轉移。在功能上，全面拓展了出口加工區保稅物流功能。由于海關特殊監管區域具備保稅加工、保稅物流、出口退稅、設備免稅、通關便捷、管理規范等政策和功能，在當前國內外經濟形勢下功能和政策比較優勢凸顯。隨著我國一系列應對危機、振興經濟措施的出臺，有的外資企業關閉了海外生產基地，優先選擇海關特殊監管區域，向我國集聚研發、結算、總部基地等高端產業鏈，海關特殊監管區域成為承接“產業轉移”、吸引外資、加工貿易轉型升級的重要平臺。
12月1日，全球第二大個人品牌電腦宏碁也落戶重慶，而仁寶、和碩、緯創等知名代工企業也隨其入渝。而此前，全球最大個人品牌電腦惠普已經在2009年率先落戶重慶，不僅帶來了富士康、英業達、廣達三大代工商和數以百計的零部件配套商，而且將全球軟件外包服務中心、全球軟件測試中心、全球軟件研發中心、中國呼叫中心等項目落戶重慶，其中惠普公司全球采購結算中心從新加坡移至重慶更是引人注目。隨著惠普產業集群扎根西永綜保區、宏碁落戶重慶兩路寸灘保稅港區，重慶將能迅速形成“2+6+n”（兩個品牌商、六個代工企業、五六百家配套廠商）的筆記本電腦產業集群，打造出全球最大、最具特色大的筆記本電腦生產基地。
統計資料也顯示，經過多年努力，加工貿易不斷轉型升級，從來料加工為主發展為進料加工占主體，產品類別歷經服裝鞋帽、家用電器、it產品，直至現在以大型裝備制造業和國際服務外包為快速增長點。加工貿易產業與產品結構不斷優化，2009年加工貿易進出口貨物中，70%以上為機電類產品，其中50%多為高科技類。同時，加工貿易產業鏈不斷延伸，深加工結轉在加工貿易中所占的比重提升迅速。加工貿易企業消化、吸收和再創新的能力不斷增強，部分企業積極向設立營運中心、研發中心乃至加強自主品牌建設等方面努力，加快實現從oem（貼牌加工）到odm（委托設計生產）到obm（自有品牌營銷）的轉變。加工貿易的增值率不斷提高，加工貿易增值率（含國內采購）由1996年的35.3%上升為2009年的82%。在地區分布上，加工貿易已從最初的深圳、東莞擴展到東南沿海，呈向中西部快速發展的態勢。
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